拥有特殊能力的少女球井紫，总是将人类看成各式各样的机器人，有时会利用这种能力『修復』受伤的朋友，甚至是协助警方侦破惨无人道的兇杀案。这个拥有紫色瞳孔的少女将会有什么稀奇古怪的遭遇呢？

莺是名奇特的少女。成天窝在图书室里，从未在教室露过面。但她考试成绩却总是满分。不知道为何，让和这样的她维持着奇妙的交情。 奇人自然会收到奇特的委托。内容是当面询问天才数学家，雾生赛马是否真为一名魔术师 。于是莺和让动身前往雾生博士所在的麒麟馆。但就在次日，雾生成为了一具无头的尸体。并且陷入嫌疑犯全员皆为清白的怪异状况！？ 究竟是否魔术师，是否凶杀，是否存在受害人，是否存在凶手，这是个将这些全部「论证」的故事。

2302年，天人的活动进入新的阶段。 描写天人过去的官方外传，世代转移至动画本篇（第一季）的五年前展开新的故事。 自00P第一季之后接近10年的岁月流逝，太阳光纷争已经终结。轨道电梯也开始稼动。

关于我们的渚的一次细微的，命中注定的某次事件的故事一年后。 她与「后辈」冈崎朋也相遇，然后相恋这次讲的则是之前的一段小插曲。 内容是，游戏的本篇中没有提及到的渚和朋也各自的过去两人之间发生过了什么。 在洒满春光的校园中向我们敞开的，是CLANNAD的另一扇门。