出品：NITROPLUS
企划+剧本+监督：虚渊玄
人设：矢野口君
音乐：ZIZZ
第一部
黑社会里接连发生了黑手党干部被暗杀的事件。在这背后流传着迷之组织「Inferno」和最强的杀手「Phantom」的传言……
一个人在国旅行的少年（主角），在Phantom杀死调查她的记者的现场，偶然遇到了Phantom，发现她其实是个与自己岁数相差无几的少女。
之后，他被Inferno的科学家Scythe Master消除了记忆，并为了取回记忆而拜被称为Phantom的少女Ein为师成为杀手。
之后，他在某天通过了杀一名SAT的考验后，正式成为了Inferno的杀手。
然后，主角得到了Zwei的代号，和Ein一起杀人。
大约过了半年左右，Zwei发现看似无感情的Ein其实是个把感情深埋在心底的人。
Ein接到了条指令后单独去执行任务了，而Zwei则担任Scythe的上司Claudia的警卫。
通过Claudia，Zwei取回了自己的记忆，记起了自己是日本的中学生吾妻玲二。此时Claudia要求主角以吾妻玲二的身份向她个人效忠。
因为记忆恢复而良心备受煎熬的玲二跑到了自己的杀手训练场所，在那里见到了身负重伤的Ein。
原来所谓的任务是Scythe让她背叛Inferno。
此时，玲二必须在三个选择中……（内容加载失败！请反馈详细信息。）